市場星報、安徽財經(jīng)網(wǎng)(xomn.cn)訊 (記者 馬冰璐)記者日前從安徽醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院獲悉,該院皮膚科、安醫(yī)大皮膚病研究所和皮膚病學(xué)教育部重點實驗室孫良丹教授團隊成功繪制了首個大規(guī)模中國人群蛋白截斷突變圖譜,該項成果在國際著名學(xué)術(shù)期刊《基因組研究》(Genome Research)發(fā)表。
蛋白截斷突變(protein-truncating variant,PTV)是指基因組中包含的終止密碼子、移碼或剪接位點突變等一系列嚴(yán)重影響蛋白編碼基因完整性和功能的遺傳變異,對于人類表型多樣性及疾病的發(fā)生發(fā)展有著重要意義。由于特定PTV在人群中的頻率通常極低,且具有較高的人群特異性,對其進行分析需要特定的大樣本人群數(shù)據(jù)及可靠的分析技術(shù),在本研究之前尚未有公開的中國人群PTV圖譜。
此次研究深入分析了10539名健康對照者和9434名銀屑病患者中1320個基因上的PTVs特征,共鑒定了8720個PTV,其中77%是之前從未報道過的,顯示其高度的人群特異性。研究人員通過新型算法,發(fā)現(xiàn)88%的PTV是有害的且受到凈化選擇的影響,顯示了自然選擇對人類遺傳變異的塑造與影響。研究還對所有鑒定得到的PTV進行了詳細的分類與解析,據(jù)此繪制了首個中國人群蛋白截斷突變圖譜,完善了該領(lǐng)域的“中國拼圖”。
該研究發(fā)現(xiàn),與對照組相比銀屑病患者攜帶的PTV更多(P=0.02),顯示其對疾病發(fā)生機制的重要影響。研究人員還通過對中、歐、非三大人群的比較,鑒定出18個在不同人群中分化水平極高的PTV,并推測其可能受到正向選擇作用,進一步凸顯了PTV的人群特異性特征。
本次研究構(gòu)建了中國人群蛋白截斷突變圖譜,進一步豐富了銀屑病遺傳變異基礎(chǔ),擴展了對于蛋白截斷變異人群特異性的認識,對中國人群的起源與演化以及疾病遺傳機制的研究具有重要意義。